天然产物具有丰富的结构多样性。与典型的合成小分子药物相比,天然产物往往包含更多的sp³杂化的桥头原子、更多的手性中心、更高的氧含量但氮含量较低、更高的分子刚性。
天然产物库按照MACCS分子指纹可以分为2624个类别,具有显著的化学多样性。
化合物种类统计
65%的天然产物符合Lipinski’s “Rule of Five” Ro5原则 。(L6160 Ro5类药天然产物库 )
类药参数分析
对天然产物库进行了详细的预测分析,涵盖了多个关键药理特性,包括化合物是否能通过血脑屏障、心脏毒性(HERG K+)、与血浆蛋白的亲和力、小肠吸收、口服吸收以及皮肤吸收能力。分析结果显示,大部分化合物展现出优良的药代动力学性质,具备良好的开发潜力。
• 13%的化合物能够通过血脑屏障,87%的不能通过血脑屏障;
• 77%的化合物有心脏毒性,23%的化合物没有心脏毒性;
• 88%的化合物与血浆蛋白的亲合力在一个合理的范围,12%在不合理的范围
• 36%的化合物极易在小肠吸收,38%的化合物可以在小肠吸收,26%的化合物难以在小肠吸收
• 44%的化合物极易口服吸收,38%的化合物可以口服吸收,18%的化合物难以口服吸收
• 88%的化合物可以通过皮肤吸收,12%的化合物难以通过皮肤吸收